隆武帝前来投靠，郑芝龙实际掌握最高兵权，但拒不出兵抗清，只得由武英殿大学士黄道周募兵迎敌，此即"将在内而相在外"的历史笑话。郑成功是郑芝龙与日本太太田川氏在日本所生，郑芝龙投降清朝，但郑成功忠于南明，逃到金厦，以沿海海岛弹丸之地立足，直至赶走荷兰人攻取台湾。郑成功因被清军逼得无路可走，而成为中国历史上的一位"伟大的民族英雄"。实际上，台湾不是"收复"而是夺取。由中国人夺取并建立政权（军政府）固然不错，还不能说就是"中国的一部分"。如果清朝政府不再去"收复"一次，台湾极有可能会发展成为独立于中国之外的一个国家；甚至有可能归于日本，连郑成功都可能被当做日本的民族英雄，——他母亲是日本人，他本人出生于日本，你怎么跟他们扯得清！琉球（隋时台湾也叫"流求"）不就变成了他们的冲绳吗？所幸康熙二十二年，清军攻占台湾，将其正式纳入中国版图。